Постоянно приходится перекомпилировать Апач. Поменять конфигурацию, добавить те или иные флаги или модули. Самое муторное -- переезд с одной системы на другую (например, с федоры на генту или обратно). Вроде всё уже делали сто раз, но система чуть другая - и пакеты не так управляются, и пути совсем не те.
Ключевые моменты - всё время от переходов от одного сервака к другому хранить configure-строку. Если какие-то модули пропали при переезде - добавить их при помощи флага --enable-modules. Как правило, у меня не хватает терпения работать с пакетами и версиями в системе "по умолчанию" - например, rpm-мами апача в шапке или е-билдами в генту, через некоторое время просто скачиваю исходники апача и компилирую из них. Если выработать устойчивую конфигурацию и сохранить у себя все настройки (httpd.conf, строку configure), со временем перекомпиляция перестаёт быть таким геморроем...